Applied Biosystems™ SNaPshot™ Multiplex Kit

Le kit de multiplexage SNaPshot® fait partie du système de multiplexage SNaPshot® . La méthode basée sur l’extension d’amorces SNaPshot® Multiplex System permet de multiplexer jusqu’à 10 polymorphismes mononucléotides (SNP). Utilisez ce système pour dépister et confirmer les SNP, détecter de légères variations de séquence, évaluer la méthylation de l’ADN, identifier les chromosomes artificiels bactériens (BAC) ou le marquage général des fragments de restriction.

• Interrogez jusqu’à 10 SNP provenant de différents amplicons dans une seule réaction d’extension de base Séparez les loci SNP qui diffèrent d’une seule paire
• de bases Une sensibilité accrue comparée au séquençage standard permet de détecter des variantes mineures (par exemple, mutations somatiques) dans un échantillon
• test Réduisez la complexité de vos expériences avec ce système
• de génotypage facile à utiliser et économique
• Un vaste corpus de littérature scientifique démontre l’utilité du génotypage, de la détection de mutations etde la cartographie. Le kit de multiplexage SNaPshot® fait partie du système de multiplexage SNaPshot® :
1) Kit de multiplexation SNaPshot® (100, 1000, 5000 tailles de réaction)
2) Norme
de taille GeneScan-120™ LIZ™ 3) Ensemble standard de matrice DS-02 pour l’ensemble de colorants E5 approprié à votre instrument

Chacun des trois composants ci-dessus est requis pour exécuter le SNaPshot®

Kit multiplex. L’ensemble Matrix Standard, cependant, n’est requis qu’à une installation initiale unique pour calibrer l’instrument pour le jeu de colorants spécifique à SNaPshot E5.

4) Le logiciel GeneMapper® v.4.0 (ou version ultérieure) est le logiciel secondaire recommandé pour l’analyse de données qui permet la mise en place de panneaux et de bacs définis par l’utilisateur pour une analyse automatisée des données.

Sinon, une analyse de pic simple et manuelle est possible avec le PeakScanner™ logiciel 1.0 (téléchargement gratuit sur le site web) pour les 310 et 3100. 3130 et 3730 instruments (PeakScanner n’est pas compatible avec les données provenant des instruments 3500). Pour les instruments 3500, le logiciel principal d’analyse de données de l’instrument permet une dimensionnation des fragments et une séparation des couleurs similaires à PeakScanner.

5) Le kit de mise au point d’amorce SNaPshot (4329538) est un kit d’accessoires utile pour la conception d’une seule expérience ou d’essai (panneau) : Analysez les amorces individuelles pour déterminer leur emplacement approximatif de taille. Cela déterminera si deux oligonucléotides produiront des signaux qui se chevauchent lorsqu’ils sont exécutés simultanément et permettra de configurer des fenêtres de loci (bins) appropriées pour les GeneMapper logiciels d’analyse.

Filtrez et confirmez les
SNPLe système SNaPshot® Multiplex est l’outil parfait pour le dépistage et la validation des SNP. Le kit offre un réactif de terminaison d’extension⁄à une seule base pour marquer les fragments d’ADN. Faites passer des fragments d’ADN sur n’importe quel Applied Biosystems instrument d’électrophorèse capillaire à l’aide de la norme de taille GeneScan-120™ LIZ® pour indiquer la taille des fragments marqués. Ensuite, utilisez le logiciel GeneMapper® pour analyser les données et générer des appels d’allèles. Le kit de multiplexage SNaPshot® permet de multiplexer lors de l’extension à base unique de jusqu’à 10 combinaisons d’amorce-gabarit dans un format tube-capillaire simple.

Évaluer la méthylation
de l’ADNL’étude de l’épigénétique de la⁄méthylation émerge comme un élément important de la recherche sur le cancer. Dans un test typique pour détecter la méthylation, le traitement par bisulfite de l’ADN désamine la cytosine non méthylée et la convertit en uracile tandis que la cytosine méthylée reste non réactive. L’étape suivante de l’amplification par PCR relie les bases de l’uracile à la thymine. Utilisez SNaPshot® pour détecter les différences de base entre les échantillons traités et non traités afin de connaître le statut de méthylation de vos échantillons.

BAC
d’empreintes digitalesLes nouvelles BAC bibliothèques nécessitent une méthode rapide et efficace pour la caractérisation (aussi appelée empreinte digitale) et l’assemblage des clones en contigs (séquences consensuelles contiguës), qui sont ensuite arrangées en cartes physiques du chromosome. Utilisez le kit multiplex SNaPshot® pour prendre des empreintes digitales sur les clones en marquant BAC les fragments après la digestion avec des endonucléases de restriction. Les fragments marqués peuvent ensuite être séparés et détectés sur n’importe quel Applied Biosystems instrument d’électrophorèse capillaire. Les informations de dimensionnement provenant de GeneMapper® Software v 4.0 ou supérieure sont importées dans les programmes d’édition et d’assemblage contig ultérieurs.

De façon similaire, tout fragment de restriction avec un surplomb de 5' peut être marqué avec un colorant fluorescent à l'aide du réactif SNaPshot.