Invitrogen™ RiboMinus™ Trousse d’isolement Bacteria 2.0 Transcriptome

Appauvrissement très efficace de 16S, 23S et 5S rRNA provenant de diverses espèces

Le RiboMinus kit d’isolation Bacteria 2.0 Transcriptome est un kit complet et automatisable qui permet l’élimination efficace et sélective de l’ARN ribosomique (ARNr) bactérien et archéobactérien à partir de l’ARN total intact (100 ng à 5 μg) en moins d’une heure.

Caractéristiques clés du RiboMinus kit Bactéries 2.0 :

• Efficace—, le Pan-Prokaryote Probe Mix inclus RiboMinus a constamment montré moins de 10% des lectures correspondant à 16S et les lectures de 23S rRNA
• Large gamme de cibles—conçues avec >150 conceptions de sondes ciblant 16S 23S et 5S rRNA provenant >de 76 espèces représentatives de bactéries et archébactéries issues de phylums et sous-phylums communs
• Le module de nettoyage des billes magnétiques Streptavidine C1 de Dynabeads MyOne pratiques—et les protocoles inclus pour les instruments Kingfisher
• Flexible— permet des entrées massives de 100 ng à 5 μg d’ARN total; fonctionne avec une large gamme d’échantillons d’ARN totaux dont les valeurs RIN varient de 5,0 –à 10,0
• Une sensibilité—élevée à la détection augmente le nombre de lectures de séquençage correspondant à des transcripts codant pour les protéines comparativement à la version précédente
• Adapté à la métatranscriptomique—qui appauuvre l’ARNr de nombreuses espèces microbiennes dans des échantillons métagénomiques

ARNr cible à partir d’un panorama de bactéries et d’archébactéries

Le RiboMinus kit Bactéries 2.0 est basé sur la technologie d’hybridation-capture et comprend un nouveau RiboMinus mélange de sonde pan-procaryote, ce qui entraîne une diminution de 4 fois des lectures ribosomales restantes et montre une amélioration significative par rapport au mélange de sonde bactérienne précédent. Le nouveau mélange de sonde comprend plus de 150 conceptions d’oligonucléiode d’ADNss, marquées à 3-biotine’. Ces conceptions ont été créées à partir de régions hautement conservées d’ARNr chez 76 espèces pan-procaryotes (voir tableau ci-dessous) et testées avec plusieurs espèces (voir la liste de compatibilité ci-dessous).

Dynabeads MyOne Kit de nettoyage de Streptavidine C1 inclus

Une fois que le mélange de sonde s’est hybridé sélectivement aux transcripts d’ARNr cible, l’élimination du complexe sonde-ARNr est complétée par capture sur Dynabeads MyOne des billes magnétiques de Streptavidine C1, laissant derrière elle de l’ARN appauvri en ARNr. Le RiboMinus kit Bactéries 2.0 comprend un module de nettoyage à billes magnétiques pour la concentration de l’ARN appauvri en ARNr, permettant une manipulation, une scalabilité et une automatisation plus faciles sur les instruments KingFisher. L’ARN appauvri en ARNr (RiboMinus ARN) résultant convient à l’analyse du transcriptome entier par RNA-Seq ou d’autres applications en aval.