Thermo Scientific™ Pierce™ TMT11plex Yeast Digest Standard

La norme Pierce TMT11plex Yeast Digest Standard comprend quatre souches congéniques de Saccharomyces cerevisiae (une lignée parentale, BY4741, et trois lignées dépourvues des protéines non essentielles Met6, His4 ou Ura2) marquées en triple (souches knock-out) ou en duplique (souche parentale) avec des réactifs marqués TMT11-plex. Les souches knock-out sont utilisées en combinaison avec la souche parentale afin de permettre la comparaison de l’abondance des peptides et des protéines pour la quantification. Norme de digestion de levure Pierce TMT11plex :
• Poudre lyophilisée prête à l’emploi, —pratique pré-marquée avec des réactifs •
TMT11plex, souches de levure de qualité—vérifiées pour le génotype, mélange équimolaire des souches
• marquées TMT, mesure quantitative—de la précision quantitative des TMT ions rapporteurs pour 11 canaux
• , excellent outil de test de contrôle qualité diagnostique—pour la quantification des protéines utilisant TMT des instruments

LC-MS/MS. Stratégies protéomiques quantitatives utilisant TMT Les réactifs permettent le multiplexage et la mesure précise de l’abondance des protéines. L’exécution réussie de TMT la quantification comprend la chromatographie optimisée, la spectrométrie de masse (EM) et l’analyse des données. Un paramètre critique pour réussir ce flux de travail est la capacité à détecter TMT de façon constante les ions fragments sur 11 canaux pour le multiplexage. Notre norme TMT11plex Yeast Digest a été spécifiquement conçue pour évaluer la performance des systèmes LC-MS/MS pour la TMT quantification, l’optimisation des méthodes MS et la validation du système. Pour le développement de méthodes, la norme TMT11plex Yeast Digest peut être utilisée pour mesurer la précision, la précision et la plage dynamique des différentes approches de spectrométrie de masse. Ces normes peuvent aider à optimiser le fractionnement hors ligne, la chromatographie, l’acquisition par spectrométrie de masse et l’analyse de données. Les applications multifonctionnelles utilisant cette norme réduisent la variabilité inter-expériences pour offrir une quantification reproductible TMT .

Références :
1. Paulo JA, O'Connell JD, Gygi SP. Une norme à triple knockout (TKO) Proteomics pour diagnostiquer l’interférence ionique dans les expériences de marquage isobarique. J Am Soc Mass Spectrom. 2016 10:1620-5.
2. Yang F, Shen Y, Camp DG 2e, Smith RD. Cromatographie à pH inversé à haut pH avec concaténation fractionnaire pour l’analyse protéomique 2D. Expert rév Proteomics. 2012 9(2) : 129-34.
3. Dayon L, Pasquarello C, Hoogland C, Sanchez JC, Scherl A. Combinaison de spectres de masse tandem à basse et haute énergie pour une quantification optimisée des peptides avec des balises isobares. J Proteomics. 2010 73(4) : 769-77.
4. Diedrich JK, Pinto AF, Yates JR 3e. Dépendance énergétique du HCD à la fragmentation des peptides : L’énergie collisionnelle en palier trouve le point idéal. J Am Soc Mass Spectrom. 2013 24(11) : 1690-9.
5. Chiva C, Sabidó E. La méthode de fragmentation uniquement HCD équilibre l’identification peptidique et la quantification d’échantillons marqués par TMT dans des spectromètres de masse hybrides linéaires à piège ionique/orbitrap. J Proteomics. 2014 96:263-70.

Produits connexes :
Pierce HeLa Protein Digest Standard  (Cat. No 88329)
Mélange de calibration du temps de rétention peptidique Pierce (Cat. No 88321)
TMT10plex ensemble de réactifs de marquage isobare plus réactif TMT11-131C (Cat. Non. A34808)