Eau indispensable pour diverses applications chromatographiques, notamment la préparation de phases mobiles et d'échantillons. L'eau utilisée dans le processus CLHP est purifiée par une combinaison de distillation, d'osmose inverse, d'irradiation ultraviolette, de filtration, d'échange d'ions et d'autres méthodes.
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Un mélange prêt à l’emploi d’eau et d’acétonitrile (v/v) à 2% sert de solution aqueuse pour nettoyer les sondes et aiguilles des échantillons sur les instruments LC.
Un mélange d’eau et d’acétonitrile prêt à l’emploi (60:40) contenant 0,1% d’acide formique sert de solution de lavage pour nettoyer les échantillons et les sondes d’injection de chromatographie liquide. Couramment utilisé comme solution de nettoyage d’auto-échantillonneur dans LC-MS.